用户申请车贷抵押绿本，主要影响是用户无法对车辆进行买卖、过户。将汽车绿本抵押给金融机构后，用户只拥有车辆的使用权，所有权归金融机构所有。必须是还清了车贷，解除了抵押，用户才可以拿回车辆的所有权，之后才可以交易、办理过户。

当然，用户也可以选择押车不押证，但是由于车辆抵押给了金融机构，用户在贷款期间是无法使用车辆的。