在平安普惠办的贷款已经还清了，但系统仍然显示还款中的话，很可能是因为客户才刚还进去不久，系统还在处理当中，款项尚未到账。建议客户刷新下页面或者退出重新登录试试。

如果仍然显示还款中的话，可以耐心等待一会儿。而若是等待了有一段时间仍然显示还款中的话，为了避免错过规定的还款期限、造成逾期，建议客户主动联系平安普惠的客服人员进行咨询，看看是怎么一回事，让对方尽快进行扣款。