小额贷款公司需要缴纳的税种和税率分别是：

增值税：3%（小规模纳税人）或6%（一般纳税人）

城市建设维护税：7%

教育费附加：3%

地方教育费附加：2%

地方水利建设基金：各地税率不同

印花税：各个项目税率不同

企业所得税：25%

个人所得税：累进税率，税率视乎收入额而定

残疾人就业保障金：个地方收费标准不同

部分小额贷款公司可能还会有：房产税、车船税、价格调节基金、工会经费等等。